Com o objetivo de avaliar o grau de incidência fúngica e o reflexo desta na qualidade fisiológica das sementes de aveia preta (Avena strigosa Schreb), foram analisados cinco lotes de sementes provenientes da zona Sul do Estado do Rio Grande do Sul, dos municípios de Pelotas, Pedro Osório, Herval e Piratini. As sementes foram analisadas pelo método de papel filtro em caixas de gerbox, com 25 sementes em 16 repetições, totalizando 400 sementes por lote, analisadas, individualmente sob microscópio estereoscópico. Os testes para qualidade fisiológica foram germinação, primeira contagem de germinação, emergência no campo, índice de velocidade de emergência, altura e peso da matéria seca de plântula. Os resultados obtidos permitiram concluir que: a) os fungos mais freqüentes em sementes de aveia preta da zona sul do Rio Grande do Sul foram Helminthosporium sp, Phoma sp., Alternaria sp., Fusarium sp., Cladosporium sp., Epicoccum sp., Rhizopus sp., Penicillium sp., Aspergillus sp., Nigrospora sp. e Curvularia sp; e b) dos gêneros que causam prejuízos à emergência de plântulas, apenas Helminthosporium sp. e Phoma sp. ocorreram em proporções elevadas.