O custo de semente, representa, no máximo, 5% do custo total de produção de cebola. Sendo assim, o mercado consumidor não exige a necessária qualidade genética e sanitária. Em, contrapartida, a constatação de doenças, até então inexistentes na região ceboleira de Santa Catarina, tem preocupado os cebolicultores do estado, evidenciando que a semente um eficiente veículo disseminador de patógenos. Com o objetivo de verificar o estado sanitário da semente comercializada em Santa Catarina, foram feitas coletas e análises de amostras das sementes comercializadas em 1989, 1991, 1992 e 1993. Foram identificados 16 gêneros de fungos, dos quais algumas espécies são fitopatogênicas. Foram detectadas sementes com Colletotrichum gloeosporioides f sp. cepae, indicando que a introdução, via semente, do patógeno, agente causal da antracnose-foliar, pode ocorrer em novas áreas ainda não afetadas pela doença. Outros importantes patógenos encontrados foram: Fusarium oxysporum f. sp. cepae, Alternaria porri, Heterosporium allii-cepae e Botrytis spp. Também foi detectada a presença de Trichoderma spp., agente de controle biológico de doenças. No trabalho são discutidos aspectos patogênicos e epidemiológicos dos principais fungos detectados.