Dois lotes de sementes de estévia (Stevia rebaudiana), aristadas ou desaristadas e armazenadas entre 17 e 65 dias, foram submetidos à termoterapia via úmida a 48º, 50º, 52º e 54ºC por 15, 30 e 60 segundos, para avaliação do efeito na ocorrência de Alternaria steviae e A. alternata. As mesmas temperaturas e tempos de exposição foram utilizados para um terceiro lote constituído de sementes desaristadas e armazenadas por 60 dias, com a finalidade de verificar os efeitos na ocorrência e transmissão dos dois fungos e na germinação das sementes. Este mesmo lote, após 150 dias de armazenamento, foi novamente submetido à termoterapia, temperaturas de 52º e 54ºC por cinco, 10 e 15 minutos, para verificar os mesmos parâmetros. Para a avaliação da ocorrência utilizou-se o método do papel de filtro com congelamento e a transmissão foi avaliada por meio da germinação das sementes em vermiculita. Os resultados mostraram que nas temperaturas de 48º a 54ºC por 15 a 60 segundos houve redução na ocorrência de A. alternata (variando de 87,5% a zero) em relação as testemunhas não tratadas, que variaram de 86,3% a 7,3%, porém o mesmo não aconteceu para A. steviae. A porcentagem de transmissão foi reduzida com o incremento nos tempos e temperaturas (variando de 26,8% a 11,5%), ocorrendo aumento de até 14,8% na porcentagem de germinação das sementes, em relação a testemunha não tratada. No tratamento a 52ºC por cinco minutos houve redução ao nível de 0,8% de A. alternata, erradicação de A. steviae nas sementes e a porcentagem de transmissão foi anulada sem, no entanto, apresentar redução significativa na porcentagem de germinação (16,5%), em relação à testemunha não tratada (16,8%). Para erradicação de A. alternata foi necessária a temperatura de 52ºC por 15 minutos, havendo redução na germinação para 11,0%.