O presente trabalho avaliou o efeito de Colletotrichum gossypii South. associado a sementes, em ocorrência natural e por inoculação artificial, sobre a germinação destas, em condições de laboratório. As sementes foram inoculadas através de seu contato direto com a colônia do fungo em desenvolvimento, em meio ágar (B.D.A.) em diferentes períodos de exposição. Parte das sementes tratadas e não tratadas com NaOCI foi utilizada para dissecação em duas frações: tegumento e embrião, sendo a sanidade das mesmas e de sementes inteiras, avaliada em separado. Os parâmetros considerados foram: incidência de C. gossypii pelo método de incubação em papel de filtro modificado (adição de ágar a 0,5% ao substrato); germinação de sementes inteiras em rolo de papel; e índice de doença em plântulas aos sete dias. O inóculo de C. gossypii localizou-se preferencialmente internamente às sementes. A desinfestação das sementes proporcionou um aumento de 54% no percentual de germinação, e reduziu o índice de doença em torno de 45%.