A freqüência e a incidência de fungos em sementes de soja são variáveis, em função de inúmeros fatores, dentre os quais as condições de clima, durante todo o ciclo da cultura, são as mais importantes. O objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência dos principais patógenos em sementes de soja, produzidas nas mais diversas e representativas regiões de produção de soja do Brasil, entre as safras 1992/93 a 1996/97. Amostras de 2.051 lotes de sementes de diversas cultivares, provenientes de nove localidades, foram analisadas quanto à sanidade, pelo método do papel-de-filtro. Cercospora kikuchii foi o patógeno mais freqüente na maioria dos locais, exceto em Rondonópolis, MT, e Dourados, MS, e também o de maior incidência média, exceto em Dourados, MS, e Imperatriz, MA. Fusarium spp. foi o fungo mais freqüente em Rondonópolis, MT, e Dourados, MS, e o de maior incidência média em Dourados, MS. Phomopsis sp. foi o patógeno de maior incidência média em Imperatriz, MA, e Colletotrichum truncatum foi o que apresentou menores níveis de freqüência e incidência média em todos os locais.