Este trabalho foi conduzido no Laboratório de Análise de Sementes do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agronômicas da Universidade Estadual Paulista (UNESP), Botucatu-SP, com o objetivo de avaliar os efeitos causados pelo alagamento na qualidade fisiológica de sementes em milho, bem como, o efeito da temperatura de alagamento na tolerância das sementes a essa condição. As sementes foram submetidas a tratamentos de alagamento por períodos de 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 e 7 dias a 27oC e à 5, 10, 15, 20, 25 e 30oC, durante três dias de alagamento. Após os tratamentos foram realizadas as avaliações de germinação, vigor (condutividade elétrica e primeira contagem do teste de germinação). A matéria seca e o crescimento das plântulas foram avaliados apenas para os diferentes períodos de alagamento. Os resultados mostram que a germinação e o vigor das sementes decresceram imediatamente após estas serem submetidas ao alagamento; houve um decréscimo de 40% a partir do terceiro dia de alagamento e, ao sétimo dia, não houve germinação. O número de sementes mortas e de plântulas anormais foi acentuado com o aumento do tempo de submersão. O peso da matéria seca e o crescimento da parte aérea das plântulas cujas sementes sofreram dois e três dias de alagamento foi superior às demais. As temperaturas de alagamento abaixo de 20oC e acima de 25oC reduziram drasticamente a germinação e vigor das sementes, aumentando o número de sementes mortas.