A utilização de sementes de boas qualidade fisiológica e sanitária no plantio é fundamental para o estabelecimento de uma lavoura com população adequada de plantas e livres de algumas doenças passíveis de transmissão por sementes, o que poderá influenciar no aumento da produtividade. Este trabalho objetivou avaliar as qualidades fisiológica e sanitária de sementes de soja, de cultivares e de linhagens de ciclo semitardio/tardio. Essas sementes foram produzidas no ano agrícola 1997/1998, nos ensaios intermediários de avaliação do comportamento de linhagens do Programa de Melhoramento de Soja da Universidade Federal de Viçosa, conduzidos nos municípios de Capinópolis, Rio Paranaíba e Florestal, no Estado de Minas Gerais. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três repetições. A qualidade fisiológica das sementes foi avaliada pelos testes de germinação, envelhecimento acelerado e emergência das plântulas em areia e a qualidade sanitária pelo teste do papel de filtro. Sementes que apresentaram maior incidência de fungos apresentaram menores viabilidade e vigor. Para a maioria dos genótipos, as sementes produzidas em Rio Paranaíba apresentaram melhor qualidade, em relação às produzidas em Florestal e Capinópolis. Sementes produzidas em Capinópolis apresentaram menor percentagem de germinação e maior ocorrência de fungos associados. As linhagens UFV 96-570816, UFV 96570818 e UFV 96-570835 se destacaram por suas sementes, produzidas nas três localidades estudadas, apresentarem nos testes de germinação e emergência das plântulas em areia, percentagem de germinação e emergência acima de 80%.